Título
Application for photogrammetry of organisms
Autor
Aleixo, Francisco Faria
Resumo
pt
Fotogrametria em câmera única é um procedimento bem estabelecido para recolher
dados quantitativos de objectos através de fotografias. Em biologia, fotogrametria é
frequentemente aplicada no contexto de estudos morfométricos, focando-se no estudo
comparativo de formas e organismos. Nos estudos morfométricos são utilizados dois tipos
de aplicação fotogramétrica: fotogrametria 2D, onde são utilizadas medidas de distância
e ângulo para quantitativamente descrever atributos de um objecto, e fotogrametria 3D,
onde são utilizadas coordenadas de referência de forma a reconstruir a verdadeira forma
de um objeto. Apesar da existência de uma elevada variedade de software no contexto de
fotogrametria 3D, a variedade de software concebida especificamente para a a aplicação
de fotogrametria 2D é ainda muito reduzida. Consequentemente, é comum observar
estudos onde fotogrametria 2D é utilizada através da aquisição manual de medidas a partir
de imagens, que posteriormente necessitam de ser escaladas para um sistema apropriado
de medida. Este processo de várias etapas é frequentemente moroso e requer a aplicação
de diferentes programas de software. Além de ser moroso, é também susceptível a erros,
dada a natureza manual na aquisição de dados. O presente trabalho visou abordar os
problemas descritos através da implementação de um novo software multiplataforma
capaz de integrar e agilizar o processo de fotogrametria presentes em estudos que
requerem fotogrametria 2D. Resultados preliminares demonstram um decréscimo de 45%
em tempo de processamento na utilização do software desenvolvido no âmbito deste
trabalho quando comparado a uma metodologia concorrente. Limitações existentes e
trabalho futuro são discutidos.
en
Single-camera photogrammetry is a well-established procedure to retrieve quantitative
information from objects using photography. In biological sciences, photogrammetry is
often applied to aid in morphometry studies, focusing on the comparative study of shapes
and organisms. Two types of photogrammetry are used in morphometric studies: 2D
photogrammetry, where distance and angle measurements are used to quantitatively
describe attributes of an object, and 3D photogrammetry, where data on landmark
coordinates are used to reconstruct an object true shape. Although there are excellent
software tools for 3D photogrammetry available, software specifically designed to aid in
the somewhat simpler 2D photogrammetry are lacking. Therefore, most studies applying
2D photogrammetry, still rely on manual acquisition of measurements from pictures, that
must then be scaled to an appropriate measuring system. This is often a laborious multistep process, on most cases utilizing diverse software to complete different tasks. In
addition to being time-consuming, it is also error-prone since measurement recording is
often made manually. The present work aimed at tackling those issues by implementing
a new cross-platform software able to integrate and streamline the photogrammetry
workflow usually applied in 2D photogrammetry studies. Results from a preliminary
study show a decrease of 45% in processing time when using the software developed in
the scope of this work in comparison with a competing methodology. Existing limitations
and future work towards improved versions of the software are discussed.